协议离婚的主管机关是民政部门。具体的婚姻登记机关，在城市是街道办事处或者市辖区、不设区的市人民政府的民政部门，在农村是乡、民族乡、镇的人民政府。在婚姻登记机关中，由持有婚姻登记管理员证书的人员从事协议离婚的登记工作。